为杜绝阴茎尖锐湿疣的复发，需注意以下几点。
(1)治疗时去除所有肉眼可见的疣体，把握治疗的范围及深度，以减少或防止复发，减少术后感染、疤痕等，并尽可能找出亚临床感染的范围，如作醋酸白试验，对亚临床感染部位一并治疗。
(2)阴茎尖锐湿疣患者的性伴侣即使无临床表现，也有可能是乳头瘤病毒携带者，因此治疗和恢复期间避免性生活，以免再次感染病毒。
(3)去除与减少各种诱发因素。阴茎尖锐湿疣复发的原因可能与患者有其他引起细胞免疫功能异常的性病或其他系统性疾病相关，因而在治疗阴茎尖锐湿疣时应全面检查有无艾滋病等疾病并及时治疗。此外需治疗包皮过长者要考虑行包皮环切术。治疗期间应避免性生活，劳逸结合，定期复查，注意性卫生，保持局部清洁和干燥，减少复发。